Он родился в семье графа Тышкевича под Вильно. Советские солдаты убили его отца, а мать под фамилией Шуткевич с маленьким сыном Яном бежала и скрывалась в Гродно.
Будущий священник учился на дирижерским факультете Московской государственной консерватории. Формацию к священству проходил в Каунасской духовной семинарии. Рукоположен в священники в 1983 г.
В историю Католической церкви в Беларуси вошел как выдающийся реставратор. С 1987 года по 1994 г. священник Ян Шуткевич являлся настоятелем прихода Св. Апостола Андрея в Лынтупах. Поднял из руин и восстановил храм св. Антония Падуанского в Поставах. Также заботился о костеле св. Яна Крестителя в Камаях и костеле в Лучае. Благодаря его усилиям и целеустремленности были восстановлены перечисленные святыни, а также также отстроены часовни в Мягунах, Маньковичах, Груздове.
В 1994—1997 гг. исполнял обязанности настоятеля минского архикафедрального собора Пресвятой Девы Марии и содействовал его реставрации. Затем исполнял обязанности ректора и резидента храма св. Варфоломея в Вильнюсе, многое сделал для восстановления святыни. Сегодня в этом храме проходят богослужения для белорусской диаспоры на белорусском языке.
Заупокойная месса состоится 7 июня в костеле Обретения Святого Креста (быв. бернардинский) в Гродно. Начало богослужения в 12:00.