Міністэрства адукацыі і навукі Літвы дазволіла адкрыць дактарантуру сумесна з універсітэтам Вітаўта Вялікага і Літоўскім інстытутам даследавання культуры.
Еўрапейскі гуманітарны ўніверсітэт быў зачынены ў 2004 годзе ў Мінску. Ад 2005 года раззмяшчаецца ў Вільні. Мае статус літоўскай ВНУ. У ЕГУ навучаюцца многія студэнты, якія былі выключаны з беларускіх ВНУ па палітычных матывах.